Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr39u1Q5M8N4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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