Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vps41Q5KU39 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms