Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWD4

Gm20816, Predicted gene, 20816, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20816Q5FWD4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20816Q5FWD4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm20816Q5FWD4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm20816Q5FWD4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm20816Q5FWD4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm20816Q5FWD4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm20816Q5FWD4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20816Q5FWD4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms