Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q5EBG8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q5EBG8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5EBG8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5EBG8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5EBG8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms