Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms