Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

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Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Znf608Q56A10 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Znf608Q56A10 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Znf608Q56A10 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms