Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GpkowQ56A08 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GpkowQ56A08 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GpkowQ56A08 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GpkowQ56A08 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GpkowQ56A08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpkowQ56A08 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms