Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt35Q497I4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms