Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Fam220aQ3ZN08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Fam220aQ3ZN08 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Fam220aQ3ZN08 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Fam220aQ3ZN08 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Fam220aQ3ZN08 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam220aQ3ZN08 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Fam220aQ3ZN08 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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