Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ulk4Q3V129 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms