Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc185Q3V118 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms