Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Garnl3Q3V0G7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Garnl3Q3V0G7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Garnl3Q3V0G7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Garnl3Q3V0G7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Garnl3Q3V0G7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Garnl3Q3V0G7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Garnl3Q3V0G7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Garnl3Q3V0G7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Garnl3Q3V0G7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Garnl3Q3V0G7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms