Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms