Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc55Q3UY51 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc55Q3UY51 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms