Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc114Q3UX62 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc114Q3UX62 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms