Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clpsl2Q3UW21 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clpsl2Q3UW21 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms