Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom2Q3UUY6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom2Q3UUY6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms