Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgef9Q3UTH8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgef9Q3UTH8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgef9Q3UTH8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgef9Q3UTH8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgef9Q3UTH8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgef9Q3UTH8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arhgef9Q3UTH8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgef9Q3UTH8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgef9Q3UTH8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms