Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B3gnt6Q3USF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms