Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc190Q3URK1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms