Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vwa5b2Q3UR50 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms