Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Mindy4Q3UQI9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Mindy4Q3UQI9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Mindy4Q3UQI9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Mindy4Q3UQI9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Mindy4Q3UQI9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Mindy4Q3UQI9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Mindy4Q3UQI9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Mindy4Q3UQI9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Mindy4Q3UQI9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mindy4Q3UQI9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mindy4Q3UQI9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mindy4Q3UQI9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mindy4Q3UQI9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mindy4Q3UQI9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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