Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms