Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BtrcQ3ULA2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BtrcQ3ULA2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms