Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpr55Q3UJF0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpr55Q3UJF0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms