Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf224Q3UIW8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms