Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zswim8Q3UHH1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms