Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef1Q3UHC1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms