Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6cQ3UHC0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnrc6cQ3UHC0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnrc6cQ3UHC0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6cQ3UHC0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6cQ3UHC0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6cQ3UHC0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6cQ3UHC0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6cQ3UHC0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms