Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph3aQ3UFY4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph3aQ3UFY4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rsph3aQ3UFY4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms