Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft2Q3UF64 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft2Q3UF64 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft2Q3UF64 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft2Q3UF64 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnft2Q3UF64 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms