Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp8Q3UD82 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp8Q3UD82 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Parp8Q3UD82 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms