Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasip1Q3U0S6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasip1Q3U0S6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms