Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc9Q3U0M1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms