Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Lrrn4clQ3TYX2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Lrrn4clQ3TYX2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Lrrn4clQ3TYX2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Lrrn4clQ3TYX2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Lrrn4clQ3TYX2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Lrrn4clQ3TYX2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Lrrn4clQ3TYX2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Lrrn4clQ3TYX2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Lrrn4clQ3TYX2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Lrrn4clQ3TYX2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrrn4clQ3TYX2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms