Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pip4p1Q3TWL2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pip4p1Q3TWL2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pip4p1Q3TWL2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pip4p1Q3TWL2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pip4p1Q3TWL2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pip4p1Q3TWL2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pip4p1Q3TWL2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pip4p1Q3TWL2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pip4p1Q3TWL2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pip4p1Q3TWL2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms