Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctdnep1Q3TP92 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdnep1Q3TP92 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms