Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Uri1Q3TLD5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uri1Q3TLD5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uri1Q3TLD5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uri1Q3TLD5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uri1Q3TLD5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms