Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp39Q3TIX9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms