Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eepd1Q3TGW2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms