Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RubcnlQ3TD16 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RubcnlQ3TD16 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms