Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem104Q3TB48 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem104Q3TB48 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms