Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prr27Q3SYJ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prr27Q3SYJ2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms