Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms