Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbtb38Q3LR78 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbtb38Q3LR78 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb38Q3LR78 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms