Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col24a1Q30D77 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col24a1Q30D77 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Col24a1Q30D77 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms