Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chrna5Q2MKA5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms