Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cers3Q1A3B0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cers3Q1A3B0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms