Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam47cQ14BE7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam47cQ14BE7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam47cQ14BE7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms