Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
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